本来はきちんと説明をしてから処置するべきですね。
１．土台を取ってやりかえるということに関しては、歯根のどの位の深さまで土台が入っているかにより異なります。深くまで入っていればはずすのはたいへんでしょうが、神経のない歯ですからはずす際には基本的にお痛みはないはずです。
２．強度についてはそのセメントというのがどのようなものかわからないため、正確にはお答えできませんが、強度だけをいうのであれば金属の方が強いのは確かです。ただしあまりにも硬すぎると逆に歯が割れやすいのも事実です。
３．強度だけをいうとやはり金属の方がかたいのですが、現在はグラスファイバーを用いた土台もでており、弾性もあり、歯への負担も軽いと言われております。ただし比較的新しい材料であるため金属ほどの長期的なデータはないのが現状です。

転院は可能です。もし信頼関係が得られないのでしたら転院もひとつの選択かもしれませんね。